(11.10で記載したものですが12.04LTSでも試したところ同様でした)
標準ではAnthyが使われていますが、GoogleのMozcの方が使いやすいと聞いたので、変更してみました。
手順は Ubuntu Japanese Team Wiki にありました。
Ubuntuソフトウェアセンターでibus-mozcを検索してでてきたibus-mozcパッケージをインストールします。
一度再起動させた後、Ibusの設定>インプットメッソド>インプットメソッドの選択>Mozcを選択して追加するだけです。
かお って入力変換すると顔文字が出てくるし、変換も結構賢くて早いです。